Yhdistys on tehnyt ja teettänyt Enäjärvestä lukuisia tieteellisiä tutkimuksia ja selvityksiä:
- Enäjärven koekalastukset ja vapaa-ajan kalastus vuonna 1996, Asko Sydänoja, Turun yliopisto 1997
- Enäjärven äyriäisplankton, Vesa Saarikari, Turun yliopisto 1997
- Yhteenvetoraportti Enäjärvellä tehdyistä tutkimuksista vuosina 1994 – 1996. Suositukset ja suunnitelma jatkotoimenpiteiksi, Asko Sydänoja, Turun yliopisto 1997
- Laskelma Enäjärven hajakuormasta, Jouko Hakala, Lounais-Suomen ympäristökeskus 1997
- Sammatin Enäjärven kaikuluotausselvitys, Kari Kinnunen ja Pertti Savola 1997
- Pohjaeläintutkimus Enäjärvestä 7.6.1996, FL Lauri Paasivirta 1996, jäsenkirje 3/1996
- Enäjärven pohjaeläimistö, FL Lauri Paasivirta 1999, Enäjärven suojeluyhdistyksen 25- vuotisjulkaisu, sivut 18-19
- Enäjärven kehitys pohjaeläimistön kertomana, FL Lauri Paasivirta 2006, jäsenkirje 3/2006 sivut 9-11
- Enäjärvi, Enäjärven suojeluyhdistys 25 vuotta –julkaisu, Enäjärven suojeluyhdistys 1999
- Suojavyöhykkeiden yleissuunnitelma Enäjärven valuma-alueella Sammatissa, Karjalohjalla ja Suomusjärvellä, MMK Susan Lyytikäinen 2001
- Enäjärven vesikasvillisuuden kartoitus, MMK Rolf Oinonen, Pentti Havia 2001
- Sammatin Enäjärven hajakuormituksen ja vesikasvillisuuden selvitysohjelman loppuraportti, Sirpa Penttilä, Uudenmaan ympäristökeskus 2001
- Suomusjärven, Sammatin ja Karjalohjan Enäjärven koekalastus 2003, Perttu Louhesto ja Petri Rannikko, Varsinais-Suomen Kalavesien Hoito Oy 2003
- Yhteenveto Sammatin jätevedenpuhdistamon purkuvesistön tilan kehittymisestä vuosina 1986 – 2003, Eeva Ranta, Länsi-Uudenmaan vesi ja ympäristö ry 2003
- Elävä Enäjärvi – 30 vuotta ympäristön hyväksi -julkaisu, Enäjärven suojeluyhdistys 2004
- Enäjärvestä, sen yläpuolisista järvistä ja siihen laskevista puroista on otettu yhdistyksen toimesta vesinäytteitä vuodesta 1978 lähtien
- Enäjärvellä on tehty hoitokalastusta nuottaamalla ja rysäpyynnillä vuosina 1996 – 2008
- Kiskonjoki-projektin alaisuudessa Enäjärvellä on tehty hoitokalastusta, niitetty vesikasveja ja suunniteltu pohjapatoa Enäjärven luusuaan
- Elävä Enäjärvi – näyttely, 12 kpl 100 x 70 cm postereita